色んな人をカバーする必要があったため、こうなっているのでしょうが、非常に分かりづらいです。
僕の場合の手順をメモしておきます。

更新通知のお知らせが届く

案内に従って、スマホで顔写真を撮って更新します。
これで終わりではありません。

交付のお知らせが届く

交付予約システムにログインします。URLはこんな。

https://gyoseireserve.azurewebsites.net/地域

IDは指定された数字で、パスワードは生年月日です。
2か月程度先まで埋まっています。

どうしてスマホで顔写真を送った時に予約までできないんですか？

当日

予約した場所に行きます。
マイナンバーカードで本人確認を行います。
このとき暗証番号も設定するので、PCを持って行って記録しておいたほうがよいでしょう。